Nakon pada komunizma u srednjoj i istočnoj Europi, zemlje jugoistočne Europe suočile su se izuzetno teškim razdobljem tranzicije. Ovo razdoblje označilo je i nekoliko godina ratovanja i krize, koja je uslijedila nakon raspada Jugoslavije. Nakon ponovne uspostave mira, pokrenuti su različiti programi obnove i razvitka zemalja u regiji. G-8, Europska unija i zemlje u regiji su u suradnji s međunarodnim organizacijama su osnovale su 1999. Pakt za stabilnost jugoistočne Europe, kako bi osigurale okvir za suradnju aktivnosti i za oblikovanje konkretnih programa. Udruženja poslodavaca su prepoznala relevantnost tih programa te su uz pomoć Međunarodne organizacije rada (ILO) i Međunarodne organizacije poslodavaca (IOE) osnovale neformalno tijelo - Forum poslodavaca jugoistočne Europe kako bi ojačale međusobnu suradnju i sudjelovanje u regionalnim programima. Udruge poslodavaca su od 1999. naovamo aktivno sudjelovale u radu Pakta za stabilnost, radile na vlastitoj izgradnji kapaciteta i jačale međusobnu suradnju kroz razmjenu znanja i iskustava i zajedničke projekte. Ta suradnja institucionalizirana je 2008. godine osnivanjem Centra za poslodavce jadranske regije (CEPOJAR) za sjedištem u Zagrebu pri Hrvatskoj udruzi poslodavaca (HUP).

S druge strane udruge poslodavaca jugoistočne Europe, pa tako i Hrvatska udruga poslodavaca, nastojale su ojačati i svoju suradnju s udrugama poslodavaca iz zemalja članica Europske unije, kako bi se pripremile za zadaće koje ih čekaju nakon ulaska matičnih zemalja u EU, te kako bi na konstruktivan način pridonosile procesu pridruživanja, aktivno zastupajući interese poslodavaca u tom procesu. Hrvatska udruga poslodavaca se s tim ciljem pridružila Inicijativi udruga poslodavaca i industrijalaca srednje i istočne Europe (CEE Initiative).