Udruga male brodogradnje i nautičkog sektora osnovana je 27. studenoga 2009. na osnivačkoj Skupštini u Splitu kao granska udruga Hrvatske udruge poslodavaca koja jedina ima sjedište u Splitu. Udruga štiti i promiče prava i interese svojih članova osobito u području uređivanja uvjeta poslovanja, odnosa s tijelima državne vlasti te zakonodavstva od važnosti za cjelokupni nautički sektor. Na Skupštini održanoj 19. ožujka 2010. u Splitu, udruga mijenja naziv u HUP Udruga nautičkog sektora. Skupština je usvojila Program rada koji definira buduće aktivnosti udruge i Izvršnog odbora.
Od osnivanja do danas, Izvršni odbor održao je 11 sjednica Izvršnog odbora, napravljen je Memorandum udruge nautičkog sektora koji imenuje sve probleme u nautičkom sektoru, od male brodogradnje do marina i čarter djelatnosti. Primjerice, udruga je vršila pritisak na nadležna tijela radi smanjenja trošarina, davala prijedloge i dopune na Nacrt zakona o pomorskom dobru i morskim lukama itd. a trenutno nastavlja aktivnosti i borbu za potpuno ukidanje trošarina. Hrvatska udruga poslodavaca je u ime udruge nautičkog sektora uputila mnoštvo dopisa Vladi RH i nadležnim ministarstvima te održala više radnih sastanaka sa Carinskom i Poreznom upravom i predstavnicima Ministarstva mora, prometa i infrastrukture. Svjesni smo da su napravljeni mali pomaci s obzirom na uloženi trud i aktivnosti. Ipak ohrabruje činjenica što su novi kadrovi u Vladi, od ministrice Dalić do novih ravnatelja Carinske i Porezne uprave konačno prepoznali našu udrugu kao partnera za rješavanje problema koje nautički sektor ima u tim resorima.